Skladování PCB vyžaduje pečlivou kontrolu podmínek prostředí, protože to je klíčový faktor ovlivňující životnost a spolehlivost. PCB jsou nejcitlivější na vlhkost, vysoké teploty a korozivní plyny ve vzduchu. Ideální skladovací prostředí by proto mělo být suché, při pokojové teplotě a se stabilním větráním. Obecně se doporučuje regulovat vlhkost mezi 40 % a 60 %. Pokud je okolní vlhkost příliš vysoká, PCB snadno absorbuje vlhkost, což může způsobit „prasknutí desky“ nebo delaminaci během následného pájení přetavením. Dlouhodobé-vystavení vzduchu také způsobí, že pájecí plošky postupně oxidují, což ovlivní pájitelnost. Vysoce přesné desky nebo desky skladované po dlouhou dobu se obvykle umísťují do odvlhčovací skříně nebo vakuově uzavřených obalů odolných proti vlhkosti{11}} spolu s vysoušecími prostředky, aby se snížil dopad vlhkosti.
Důležité je také balení a umístění. Různé fáze vývoje PCB vyžadují různé úrovně ochrany. Nenamontované holé desky jsou obvykle utěsněny v anti-statických sáčcích, aby se zabránilo hromadění statické elektřiny a oxidaci kovů. U desek plošných spojů s namontovanými součástmi je zapotřebí další tlumicí materiál, aby se zabránilo poškození kolize během přepravy nebo manipulace. Během skladování je třeba se vyhnout velkému stohování, zejména u vícevrstvých desek nebo desek velkých{5}}rozměrů, protože dlouhodobé namáhání může vést k mírnému zkroucení nebo dokonce ke změnám vnitřního strukturálního napětí. Při skladování se nedoporučuje přímý kontakt se zemí nebo blízkost stěn, aby se minimalizoval dopad zpětného toku vlhkosti a kolísání teploty.
Při dlouhodobém{0}}skladování nebo správě zásob je třeba zvážit také pravidelné kontroly a kontrolu data expirace. PCB nejsou produkty, které lze skladovat neomezeně dlouho. I v dobrých prostředích vrstvy povrchové úpravy (jako je OSP, ponorné zlato a pájení) časem pomalu stárnou. Obvykle se proto nastavují cykly inventury, jako je opakovaná{4}}kontrola každé 3 nebo 6 měsíců. Re-kontrola zahrnuje kontrolu oxidace, změny barvy podložky a neporušenost obalu odolného proti vlhkosti-. Pokud je zjištěna mírná oxidace, lze pájitelnost obnovit profesionálním čištěním nebo přepracováním.
